[사업공고] [질병관리청] SFTS 매개 참진드기 2종의 DNA바코드 데이터 축적 및 권역별 지리적 변이 분석 (~5.7(화))
작성자 조회수65 등록일2024-04-04제안요청서_STFS 매개 참진드기 2종의 DNA바코드 데이터 축적 및 권역별 지리적 변이분석.pdf [183.1 KB] 미리보기
1. 사업명 : SFTS 매개 참진드기 2종의 DNA바코드 데이터 축적 및 권역별 지리적 변이 분석
2. 추진배경 및 필요성
○ 곤충매개성 질병들은 과거부터 지금까지 인간과 밀접한 관계를 가지며 유지되고 있으며 소, 돼지 같은 동물의 가축화는 이러한 매개성 질병들을 유지시키는 요소가 되고 있음
○ 중증열성혈소판감소증후군(SFTS: Severe fever with thrombocytopenia syndrome)으로 불리는 SFTS바이러스 감염에 의해 발병하며 심한 경우 사망에 이르는 질병임. SFTS바이러스는 주로 참진드기과에 속한 진드기를 통해 사람에게 전파되며 국내에서도 참진드기로 인한 SFTS가 발병되고 있음
○ 참진드기과는 전세계적으로 분포하며 14속 702종이 알려져 있음 (Guglielmone et al., 2010). 편평한 타원형 몸을 가지고있으며 성체는 다른 거미처럼 8개의 다리를 가지지만 약충은 6개만 가지고 있음. 등쪽표면에 딱딱한 판을 가지고 있으며 이것은 종을 구분하는데 사용됨. 진드기는 머리에 협각과 hypostome로 구성되어있으며 먹이를 먹는 동안에는 숙주에 고정하고 통증을 숨길 수 있는 마취제 성분을 분비하여 섭식함 이는 혈액의 응고를 방지해줌(Umaine, Tick Lab)
○ SFTS바이러스 감염에 의한 사망/사고 사례는 국내에서 매년 보고되고 있으며 사람들의 관심도 또한 증가하고 있음
○ 국내외에서 참진드기의 관련된 샘플링은 지속적으로 이루어지고 있으나 이를 통한 분자적 데이터의 축적은 비교적 미비함. 따라서 연구를 통해 국내에서 많이 발견이 되고 있는 개피참진드기와 일본참진드기 2종의 DNA 바코드 데이터의 축적이 필요할 것으로 보여지며 분자 마커를 통해 권역별 참진드기의 집단 변이를 확인하여 집단별 SFTS감염의 차이의 확인이 필요해 보임
3. 사업목적
○ 참진드기 2종의 DNA의 바코드 데이터를 축적하며 집단 간 지리적 변이 데이터를 통해 향후 권역별 SFTS감염률 연계한 집단 분석에 활용
○ 개피참진드기와 일본참진드기의 DNA바코드 축적
○ 개피참진드기와 일본참진드기의 권역별 유전적 변이 확인
4. 사업기간 :
- 계약체결일로부터 ~ 2024. 11. 30.
- 소요 예산 : 50,000,000원(부가가치세 포함)
5. 사업 수행체계
○ 질병관리청 매개체분석과
- 용역에 필요한 개피참진드기 및 일본참진드기 샘플 제공
- 최소 10개 지역에서 10개체 이상
○ 용역 업체
- 개피참진드기와 일본참진드기 DNA바코드 축적
- 개피참진드기와 일본참진드기 권역별 유전적 변이 확인
- 결과 분석 및 보고서 제출
○ 사업 추진 체계도
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발주부서(매개체분석과) |
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용역기관(연구책임자) |
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- 사업 기획 및 관리 - 전국 지역별 채집한 개피참진드기, 일본참진드기 샘플 제공 10개 지역에서 10개체 이상 |
- 진드기에서 DNA 추출 및 DNA 바코드 서열 축적 - 지역별 유전적 변이 확인 |
6. 사업 내용
○ 개피참진드기와 일본참진드기의 DNA바코드 축적
- DNA의 추출시에는 장내 미생물 또는 숙주의 유전자의 영향을 줄이기 위해 에틸알코올을 이용해 세척 후 장을 제외한 나머지 부분을 이용하여 DNA 추출
- HCO2198/LCO1490 프라이머외 증폭률이 높은 프라이머 선정 사용
- COI (primary barcode marker) 이외 12S rDNA프라이머와 16s RNA, ITS 등 분석률이 높은 프라이머 선정·검증하여 secondary barcode marker 발굴
- COI gene과 secondary marker 2종을 이용하여 분자계통학적 분석함
- PCR 및 시퀀싱을 통해 참진드기의 서열을 확보한 후 권역별로 데이터 정리
○ 개피참진드기와 일본참진드기의 권역별 유전적 변이 확인
- MEGA software를 사용하여 염기서열들을 alignment를 수행하고 Neighbor-Joining tree를 구축하여 집단 간 또는 지역 간의 유전적 차이와 다양성(haplotype)을 확인
- DNASP 6.0을 사용하여 시퀀스 haplotype분석 및 데이터 추출
- NETWORK 10.2.0.0을 통하여 COI haplotypes과 12S haplotype의 median-joining (MJ) networks를 분석하여 그들의 지리적 분화 및 다양성 등 진화적 관계를 분석하고 추론
7. 추진일정
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세부 연구 내용 |
월별 수행 계획 |
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참진드기 2종의 DNA바코드 데이터 축적 |
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참진드기 2종의 권역별 집단변이 분석 |
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* 상기 내용의 수행을 위해 세부적인 사항은 질병관리청 매개체분석과 및 설치 업체와의 협의에 의해 일부 수정·보완 등 변경될 수 있음
